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Los programas de especialización, maestría y doctorado de la Facultad de Ingeniería surgieron de manera natural frente al crecimiento de los grupos de investigación de la dependencia académica, y han sido un aspecto clave en el crecimiento de los mismos. Los procesos de investigación y de formación se gestan desde el interior de los grupos, los cuales tienen una activa participación en los programas de posgrado, desde la oferta de los cupos para los futuros aspirantes hasta la estructuración de los cursos electivos a tomar por los estudiantes.
La relación que existe entre la investigación y los programas de especialización, maestría y doctorado de la Facultad de Ingeniería ha dado origen al Unidad de Posgrados. Esta unidad consolida los procesos académicos y administrativos relacionados con los programas de dichos posgrados, así como los aspectos técnicos de los proyectos de investigación desarrollados por los grupos adscritos a la Facultad.
Si bien cada uno de los grupos de investigación tiene sus líneas y agenda de investigación bien definidas, desde el Unidad de Posgrados se busca fomentar el trabajo entre grupos para dar lugar a proyectos interdisciplinarios con un impacto en la sociedad. De esta manera, la innovación se ha convertido en el principal objetivo de la investigación en la Facultad de Ingeniería.